中国北方民族研究所所长魏坚教授认为，这个遗址可能是月氏人的文化，首先这个遗址出土了大量的陶器，而这种陶器和匈奴人没有直接关系的证据。其二，在匈奴进入巴里坤前，是月氏人的地盘。另外，有资料可查，在蒙古国出土的一处匈奴墓特点和东黑沟遗址不同。

    西北大学教授王建新等学者则认为，这个墓葬反映的是匈奴人的文化。因为东黑沟遗址的墓坑呈东西向的长方形或椭圆形，小型墓葬用片状石块垒砌成仅能容身的石棺，上面顺着墓室方向用较细的圆木盖有棚木。这些墓制特征和随葬品组合与巴里坤黑沟梁墓地基本相同。有资料显示，这类墓葬属汉代匈奴遗存。另外，著名的裴岑碑记载了东汉顺帝永和二年（137年）敦煌太守裴岑率军在这里诛灭匈奴呼延王之事，而裴岑碑原来就出在东黑沟遗址附近的石人子村。因此，该遗址的主人可能是匈奴人。